財政部臺北國稅局表示，本國公司股票與外國公司股票交換，或本國公司股票與另一本國公司股票交換，本國公司股票應依證券交易稅條例規定，會計事務所課徵證券交易稅。

該局指出，證券交易稅條例第1條第1項規定所謂「買賣」有價證券，並不以實際有買賣行為或訂有買賣契約為限，尚包括交換或其他有償移轉有價證券之行為類型。股票交換亦屬買賣行為之態樣，只是其對價為股票而非現金，但不影響其實質交易行為。
該局舉例，會計事務所甲君以其所持有之外商Ａ公司股票移轉與乙公司，並取得乙公司所有之B公司股票，就乙公司將B公司股票移轉登記與甲君，因其所交換之標的為我國公司法第162條規定簽證發行之股票，台南會計，公司補償個人因職業傷害所支付之醫療費用，徵免所得稅依財政部90年4月4日台財稅字第0900451026號函釋，應課徵證券交易稅。

該局呼籲，現行股票交易型態多樣化，會計事務所民眾對於買賣有價證券應否課徵證券交易稅若持有疑義，歡迎來電洽詢。